Part of scaffold_84 (Scaffold)

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Potential Gene Matches

The following genes have been identified as possible orthologs in this organism.

BT.104999 ENSBTAG00000006027 (Cow)

Gene Details

Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

External Links

Gene match (Ensembl Protein ID: ENSBTAP00000007921, Cow)

Protein Percentage 98.89%
cDNA percentage 97.08%
Ka/Ks Ratio 0.05108 (Ka = 0.0056, Ks = 0.1093)

Additional orthologs identified in other species via the OPTIC pipeline.

Genome Location

Sequence Coding sequence

Length: 8667 bp    Location:1015767..1147411   Strand:+
>bmy_02997
CTGAAACACTGTAGTCGGTATATACATGACTTATTTCCTTCACTCATCAAGAATTTGGATCCAGTACCACTTAGACATCTTCTTAATCTGGTCTCAGCTCTTGAACCAAGTGTTCATACTGAACAGACACTGTACTTGGCATCGATGTTAATTAAAGCATTGTGGAATAATGCGCTAGCAGCTAAGGCCCAGCTATCTAAACAGAGTTCTTTTGCATCTTTACTAAACACTAATCTTCCCATTGGAAATAAGAAAGAGGACGAAGAGCTCAGAAGAGCTGCACCATCACCTTGGTCACCTGCAGCCAGTCCTCAAAGCAGTGATAACAGCGATACCCACCAAAGTGGAGGCAGTGACATTGAAATGGATGAGCAACTTATTAATAGAACCAAACATGTGCAGCAGCGACTTTCAGATACAGAGGAATCCATGCAGGGAAGTTCTGATGAAACTGCCAACAGTGGTGAAGATGGAAGCAGTGGTCCTGGTAGCAGTAGTGGACATAGTGATGGATCTAGCAATGAGGTGAATTCTAGCCATGCAAGCCAGTCAGCAGGGAGCCCTGGCAGTGAGGTACAGTCAGAAGACATTGCAGATATTGAAGCCCTTAAAGAAGAAGATGAAGATGACGATCATGGTCATAATCCTTCTAAAAGCAGTTGTGGTACAGATCATCGGAACAGGAAATTAGAAAGTCAAGCAGGCATTTGCTTAGGGGATTCCCAAGGCCCATCAGAAAGAAGTGGGACAAGCAATGGAACAGGAAAGGACCTGGTTTTTAACACTGAGTCAGTTCCATCAGTAGATAATCGAATACGAATGCTAGATGCCTGTTCACACTCTGAAGACCCAGAACATGATATTTCAGGGGAAATGAATGCTGCTCATATAGCACAAGCATCTCAGGAATCTTGTATTACACGCACTGGGGACTTTCTTGGGGAGACTATTGGGAATGAATTATTTAATTGTCGGCAGTTTATTGGTCCACAGCATCACCACCACCACCACCACCATCATCACCACCACGATGGTCATATGGTTGATGATATGCTAAGTGCAGATGATGTCAGTTGCAGCAGCTCCCAGGTCAGTGCAAAATCAGAAAAAAATATGGCTGATTTTGATGGTGAAGAATCTGGGTGTGAAGAGGAGCTAGTTCAGATTAATTCACATGCAGAGCTAACATCTCATCTCCAACAACATCTTCCCAATTTAGCATCTATTTACCATGAACATCTTAGTCAAGGACCTACAGTTCATAAACATCAATTCAGCAGTAATGCTGTAACAGACATTAATTTGGATAACGTTTGCAAGAAAGGAAACACTTTGTTGTGGGATATAGTCCAAGATGATGATGCAGTTAATCTTTCTGAAGGATTAATAAATGAAGCAGAGAAACTTCTCTGTTCCTTAGTATGTTGGTTTACGGATAGACAGATTCGAATGAGGTTCATTGAAGGTTGCCTTGAAAATTTAGGAAACAACAGATCAGTAGTAATTTCACTTCGTCTTCTTCCAAAACTGTTTGGTACTTTTCAGCAGTTTGGGAGCAGTTATGATACACATTGGATTACAATGTGGGCAGAAAAAGAACTGAACATGATGAAGCTTTTCTTTGATAATTTGGTRTACTATATTCAAGCTGTAAGAGAAGGAAGACAGAAACATGCACTGTACAGCCATAGTGCCGAAGTTCAAGTGCGGCTTCAGTTCTTAACTTGCGTGTTTTCAACTCTGGGATCTCCTGATCATTTCAGGTTAAGTTTGGAGCAAGTTGATATTTTATGGCATTGTTTAGTAGAAGATTCTGAGTGTTATGATGATGCACTCCATTGGTTTTTAAATCAAGTTCGAAGTAAAGATCAACATGCTATGGGAATGGAAACCTACAAACATCTTTTCCTGGAGAAGATGCCCCAGCTAAAACCTGAAACGATTAGCATGACTGGCTTAAACCTATTTCAGCATCTCTGTAACTTGGCTCGATTGGCTACCAGTGCCTATGATGGTGGTTCAAACTCTGAGCTTTGTGGTATGGACCAATTTTGGGGCATTGCTTTAAGAGCACAGTCTGGGGATGTCAGTCGAGCAGCTATCCAGTATATTAACTCCTATTATATTAATGGTAAAACGGGTTTGGAGAAGGAGCAAGAATTTATTAGTAAGTGTATGGAGAGTCTTATGATAGCTTCTAGCAGTCTTGAACAGGAATCACACTCAAGTCTCACTGTTATAGAAAGAGGACTCCTTATGCTGAAGACACATCTGGAAGCATTTAGGAGAAGGTTTGCATATCATCTCAGACAGTGGCAAATTGAAGGCACGGGTATTAGTAGTCATTTGAAAGCACTGAGTGACAAACAGTCCCTGCCGTTAAGGGTTGTATGCCAGCCAGCTGGACTCCCTGACAAGATGACTATTGAAATGTATCCTAGTGACCAGGTAGCAGATCTTAGGGCTGAAGTAACTCATTGGTATGAAAATTTACAGAAAGAACAAATAAATCAACAAGCTCAGCTTCAGGAGTTTGGTCAAAGCAGCCGAAAGGGAGAATTTCCTGGAGGCCTTATGGGACCAGTCAGGATGATTTCATCTGGACATGAATTAACAACAGATTATGATGAGAAAGCACTTCATGAGCTTGGTTTTAAGGATATGCAGATGGTATTTGTATCTTTGGGTGCACCAAGGAGAGAACGGAAAGGGGAAGGTGTTCAGCTGCCAGCATCTTGCCTACCACCCCCTCAGAAGGACAACATTCCGATGCTTTTGCTTTTACAAGAACCTCATTTAACTACTCTTTTTGATTTATTAGAGATGCTCGCATCATTTAAACCACCCTCAGGAAGAATGGCAATTGAAGATAGTGAGAGCTTAAGATGTGAAGAACTTCATCTTCATGCAGAAAACCTCTCTAGGCGTTGTAATGATGGACTTAATTGGAAAGAACTGCTCAAAATTAAGAGTGCTCACAAGCTATTATATGCCCTTGAAATTATTGAAGCACTGGGAAAACCTAACAGAAGAATAAGAAGAGAGTCAACGGGAAGTTATAGTGATCTTTATCCAGATTCAGATGATTCAAGTGAGGATCAAGTGGAAAATAGTAAAAATTCCTGGAGTTGCAAGTTTGTTGCTGCTGGAGGGCTTCAACAGTTATTAGAAATTTTTAATTCTGGAATTCTAGAGCCAAAAGAGCACGAATCCTGGACTGTGTGGCAGCTAGACTGTCTTGCTTGCTTGCTGAAGTTAATATGCCAGTTTGCAGTAGATCCATCCGATTTGGATTTAGCTTATCATGATGTCTTTGCCTGGTCTGGTATAGCAGAAAGCCATAGGAAAAGAACATGGCCTGGCAAATCGAGAAAGGCTGCTGGTGATCATGCCAAGGGTCTTCATATACCAAGATTAACAGAGGTATTTCTTGTTCTTGTCCAAGGAACCAGTTTGATTCAGCGACTTATGTCTGTTGCTTATACGTATGATAATCTGGCTCCTAGAGTTTTGAAAGCTCAGTCTGATCACAGGTCTAGACATGAAGTTTCACATTATTCAATGTGGCTCTTGGTGAGTTGGGCTCATTGCTGTTCTTTAGTGAAATCTAGCCTTGCTGACAGTGATCATTTACAAGATTGGCTAAAGAAATTGACTCTCCTTATTCCTGAGACTGCAGTCCGTCATGAATCTTGCAATGGTCTTTATAAGTTATCTCTGTCAGGGCTGGATGGAGGAGACTCAATCAATCGCTCTTTTCTGCTACTGGCTGCCTCAACATTGCTGAAATTTCTTCCAGATGCTCAAGCACTCAAACCTATTAGGATAGATGATTATGAAGAAGAACCAATGTTAAAACCTGGATGTAAAGAATATTTTTGGTTGTTGTGCAAATTAGTTGACAACATACATATAAAGGATGCTAGTCAGACAACACTCCTCGACCTGGATGCTTTGGCACGACATTTAGCTGACTGTATTCGAAGCAGGGAGATCCTTGATCATCAAGATGGGAATATAGAAGATGATGGGCTTACAGGACTCCTAAGGCTTGCAACAAGTGTTATTAAACACAAACCACCCTTTAAATTTTCAAGGGAAGGACAGGAATTTTTAAGAGATGTCTTCAATCTCCTGTTTTTGTTGCCTAGTCTAAAAGATAGACAACAGCCAAAGTGCAAATCACATTCTTCGAGAGCTGCTGCTTATGATTTGTTAGTGGAGATGTATTCTGAAGATATGAAGCACAAGACCACTCTCCTGGAGCTTCAAAAAATGTTTACATATTTAATGGAGAGTGAATGCAAAGCATATAATCCTAGACCCTTTTGTAAAACATACACCATGGATAAGCAGCCTCTGAACACTGGGGAGCAGAAAGATATGACAGAGTTTTTTACTGATCTGATTACTAAAATTGAAGAAATGTCTCCAGAACTGAAAAATACTGTCAAAAGTTTGTTTGGAGGTGTAATTACAAACAATGTTGTATCCTTGGATTGTGAACATGTTAGTCAGACTGCTGAAGAGTTTTACACCGTGAGGTGCCAGGTGGCTGATATGAAGAACATTTATGAATCTCTTGATGAAGTTACTATTAAAGATACTTTAGAAGGTGACAACATGTATACTTGTTCTCATTGTGGGAAGAAAGTACGAGCTGAAAAAAGAGCATGTTTTAAGAAATTGCCTCGGATTCTGAGTTTCAATACTATGAGGTATACATTTAATATGGTCACAATGATGAAAGAGAAAGTGAACACACACTTTTCCTTCCCATTACGTTTGGATATGACACCCTATACAGAAGATTTTCTTATGGGAAAGAGTGACAGGAAAGAAGGTTTCAAGGAAGTCAGTGATCATTCAAAAGACACAGAGAGCTATGAGTATGACTTGATAGGAGTGACTGTTCACACAGGAACAGCAGATGGTGGACACTATTACAGCTTCATTAGAGATATAGTCAATCCACATGCTTATAAAAACAATAAATGGTA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Related Sequences

bmy_02997T0 Protein

Length: 2889 aa     
>bmy_02997T0
LKHCSRYIHDLFPSLIKNLDPVPLRHLLNLVSALEPSVHTEQTLYLASMLIKALWNNALAAKAQLSKQSSFASLLNTNLPIGNKKEDEELRRAAPSPWSPAASPQSSDNSDTHQSGGSDIEMDEQLINRTKHVQQRLSDTEESMQGSSDETANSGEDGSSGPGSSSGHSDGSSNEVNSSHASQSAGSPGSEVQSEDIADIEALKEEDEDDDHGHNPSKSSCGTDHRNRKLESQAGICLGDSQGPSERSGTSNGTGKDLVFNTESVPSVDNRIRMLDACSHSEDPEHDISGEMNAAHIAQASQESCITRTGDFLGETIGNELFNCRQFIGPQHHHHHHHHHHHHDGHMVDDMLSADDVSCSSSQVSAKSEKNMADFDGEESGCEEELVQINSHAELTSHLQQHLPNLASIYHEHLSQGPTVHKHQFSSNAVTDINLDNVCKKGNTLLWDIVQDDDAVNLSEGLINEAEKLLCSLVCWFTDRQIRMRFIEGCLENLGNNRSVVISLRLLPKLFGTFQQFGSSYDTHWITMWAEKELNMMKLFFDNLVYYIQAVREGRQKHALYSHSAEVQVRLQFLTCVFSTLGSPDHFRLSLEQVDILWHCLVEDSECYDDALHWFLNQVRSKDQHAMGMETYKHLFLEKMPQLKPETISMTGLNLFQHLCNLARLATSAYDGGSNSELCGMDQFWGIALRAQSGDVSRAAIQYINSYYINGKTGLEKEQEFISKCMESLMIASSSLEQESHSSLTVIERGLLMLKTHLEAFRRRFAYHLRQWQIEGTGISSHLKALSDKQSLPLRVVCQPAGLPDKMTIEMYPSDQVADLRAEVTHWYENLQKEQINQQAQLQEFGQSSRKGEFPGGLMGPVRMISSGHELTTDYDEKALHELGFKDMQMVFVSLGAPRRERKGEGVQLPASCLPPPQKDNIPMLLLLQEPHLTTLFDLLEMLASFKPPSGRMAIEDSESLRCEELHLHAENLSRRCNDGLNWKELLKIKSAHKLLYALEIIEALGKPNRRIRRESTGSYSDLYPDSDDSSEDQVENSKNSWSCKFVAAGGLQQLLEIFNSGILEPKEHESWTVWQLDCLACLLKLICQFAVDPSDLDLAYHDVFAWSGIAESHRKRTWPGKSRKAAGDHAKGLHIPRLTEVFLVLVQGTSLIQRLMSVAYTYDNLAPRVLKAQSDHRSRHEVSHYSMWLLVSWAHCCSLVKSSLADSDHLQDWLKKLTLLIPETAVRHESCNGLYKLSLSGLDGGDSINRSFLLLAASTLLKFLPDAQALKPIRIDDYEEEPMLKPGCKEYFWLLCKLVDNIHIKDASQTTLLDLDALARHLADCIRSREILDHQDGNIEDDGLTGLLRLATSVIKHKPPFKFSREGQEFLRDVFNLLFLLPSLKDRQQPKCKSHSSRAAAYDLLVEMYSEDMKHKTTLLELQKMFTYLMESECKAYNPRPFCKTYTMDKQPLNTGEQKDMTEFFTDLITKIEEMSPELKNTVKSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDMTPYTEDFLMGKSDRKEGFKEVSDHSKDTESYEYDLIGVTVHTGTADGGHYYSFIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFDSAQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMDFSFEKTHSAYMLFYKRMEPEEENGKEYKFDVSSELLEWIWHDNMQFLQDKNIFEHTYFGFMWQLCSCIPSTLPDPKAVSLMTAKLSTSFVLETFIHSKEKWFLDRMADDDWWPMQILIKCPNQIVRQMFQRLCIHVIQRLRPVHAHLYLQPGMEDGSDDMDASVEDIGGRSCVTRFVRTLLLIMEHGVKPHSKHLTEYFAFLYEFAKMGEEESQFLLSLQAISTMPQVEVLSEEEGEEEEEEEDILSLAEEKYRPAALEKMIALVALLVEQSRSERHLTLSQTDMAALTGGKGFPFLFQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAEHIVSMLFTSIAKLTPEAANPFFKLLTMLMEFAGGPPGMPPFASYILQRIWEVIEYNPSQCLDWLAVQTPRNKLAHSWVLQNMENWVERFLLAHNYPRMFRSTRSLHIPTRDLPLSPDTTVVLHQVYNVLLGLLSRAKLYVDAAVHGTTKLVPYFSFMTYCLISKTEKLMFSTYFMDLWNLFQPKLSEPAIATNHNKQALLSFWYNVCADCPENIRLIVQNPVVTKNIAFNYILADHDDQDVVLFNRGMLPAYYGILRLCCEQSPAFTRQLASHQNIQWAFKNLTPHASQYPGAVEELFNLMQLFIAQRPDMREEELEDIKQFKKTTISCYLRCLDGRSCWTTLISAFRILLESDEDRLLVVFNRGLILMTESFNTLHMMYHEATACHVTGDLVELLSIFFSVLKSTRPYLQRKDVKQALIQWQERIEFAHKLLTLLNSYSPPELRNACIDVLKELVLLSPHDFLHTLVPFLQHNHCTYHHSVLVAYEGLPLHLALFPKLWTELCQTQSAMSKNCIKLLCEDPVFAEYIKCILMDERTFLNNNIVYTFMTHFLLKVQGQVFSEANCANLISTLITNLINQYQNLQSDFTNRVEISKASAALNGDLRALALLLSVHTPKQLNPALIPTLQELLSKCRTCLQQRNSLQEQEAKERKTKDDEGATPVKRRRVSSDEEHTVDSCISDMKTETREVLTPTSTSDNETRDSSIIDPGTEQDLPSPENSSVKEYRMEVPSSFSEDMSNIRSQHTEEQSNNVRFEDCKEFKDLHCSKDSSLAEEESEFPSTSLSAVLSDLADLRSCDGQALPSQDPEAALSLSCGHSRGLFSHMQQHDILDTLCRTIESTIHVVTRISGKGNQAAS*